47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1832 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  48.41 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  49.6 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  45.04 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  45.8 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  44.27 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  43.31 
 
 		 168 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  40.94 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  38.64 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  39.23 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  38.98 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  40 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  39.82 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  36.22 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  37.9 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  33.6 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  34.02 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  38.84 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  32.52 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  32.14 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  39.24 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  37.21 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  37.98 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  43.66 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  37.98 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  35.9 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  36.14 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  34.94 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  38.57 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  38.57 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  38.1 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  36.05 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  38.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  31.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  31.58 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  36.25 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  36.9 
 
 		 116 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  36.9 
 
 		 116 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  38.57 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  35.43 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  31.4 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  34.48 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  44.83 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>