26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0961 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  246  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  57.26 
 
 
148 aa  146  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  58.12 
 
 
143 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  56.78 
 
 
162 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  56.78 
 
 
143 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  56.1 
 
 
141 aa  138  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  56.9 
 
 
138 aa  134  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  57.8 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  53.39 
 
 
127 aa  126  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  50.85 
 
 
129 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  56.9 
 
 
129 aa  122  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  57.6 
 
 
149 aa  120  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  58.47 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  54.7 
 
 
145 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  35.59 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  34.75 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  34.43 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  36.13 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  35.04 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  36.13 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  36.13 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  33.04 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  35.53 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  36.08 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  35.29 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  34.71 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>