41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1635 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  100 
 
 		 168 aa  333  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  60.87 
 
 		 140 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  60.14 
 
 		 140 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  60.87 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  60.33 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  51.97 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  51.18 
 
 		 135 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  48.92 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  47.41 
 
 		 147 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  43.31 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  35.25 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  36.07 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  34.95 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  32.5 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  34 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  39.78 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  39.33 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  32.63 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  32.2 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  31.48 
 
 		 115 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  31.54 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  38.27 
 
 		 131 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  34.75 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  35.9 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  37.07 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  35.9 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  31.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  35.9 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  43.21 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  31.93 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  27.59 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  31.36 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  29.92 
 
 		 127 aa  44.3  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  28.93 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  30.51 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  33.05 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  32.46 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  35.94 
 
 		 152 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  35.71 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  25.47 
 
 		 108 aa  40.8  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>