32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1649 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  335  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  61.21 
 
 		 169 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  60.67 
 
 		 171 aa  164  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  57.75 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  33.59 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  39.31 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  37.08 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  33.06 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  41.18 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  35.38 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  32.48 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  38.89 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  34 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0844  DoxX family protein  35.38 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450101  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  34.71 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  36.56 
 
 		 115 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  32.67 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  35.48 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  35.48 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  40.19 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  36.11 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  34.83 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  35.64 
 
 		 140 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  35.64 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  38.04 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  34.02 
 
 		 121 aa  44.3  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  32.63 
 
 		 118 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  34.65 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  36.08 
 
 		 124 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  35.42 
 
 		 124 aa  42  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  26.27 
 
 		 118 aa  41.2  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>