32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4712 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  308  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  79.84 
 
 		 131 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  38.1 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  39.08 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  35.05 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  36.05 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  43.69 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  37.37 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  39.33 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89084  predicted protein  33.82 
 
 		 256 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0362829  decreased coverage  0.00339448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  32.74 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  34.62 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  35.44 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  37.72 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  32.18 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  31.86 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  34.83 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  37.8 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  29.9 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  34.23 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  30.91 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  44.74 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  33.33 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  32.73 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48590  predicted protein  35.51 
 
 		 289 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.947306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  38.27 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  38.27 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  31.68 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  31.68 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  43.43 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>