41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1423 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  99.24 
 
 
131 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  65.28 
 
 
144 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  65.67 
 
 
134 aa  176  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  56.35 
 
 
137 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  52.67 
 
 
134 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  52.25 
 
 
111 aa  120  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  55.56 
 
 
132 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  49.57 
 
 
127 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  48.98 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  52.99 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  42.24 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  47.96 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  41.44 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  41.33 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  41.03 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  45.59 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0720  hypothetical protein  34.94 
 
 
88 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  34.44 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0185  hypothetical protein  34.94 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112933  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0572  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100695  hitchhiker  0.0053973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0550  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34704  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0560  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  35.45 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  33.82 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  38.57 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  33.77 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  31.3 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  43.33 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  35.14 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  32.56 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  33.72 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  32.05 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  30.91 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  39.44 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  29.69 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  38.27 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  38.27 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  29.17 
 
 
147 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>