40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1742 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  228  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  73.28 
 
 		 116 aa  170  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  73.28 
 
 		 116 aa  170  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  37.84 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  38.1 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  37.14 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  37.86 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  38.74 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  34.86 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  35.51 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  32.41 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  35.4 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  34.86 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  34.23 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  36.08 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  37.76 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  32.94 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  37.65 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  31.53 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  34.23 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  36.47 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  29.29 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  28.95 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  31.82 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  32.43 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  31.37 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  36.21 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  38.16 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  28.44 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  36.14 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  28.79 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  27.52 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>