41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1803 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  79.85 
 
 
144 aa  228  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  65.67 
 
 
141 aa  176  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  65.67 
 
 
141 aa  176  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  64.93 
 
 
131 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  55 
 
 
137 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  48.15 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  50.88 
 
 
111 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  47.54 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  47.27 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  53.66 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  38.58 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  44.25 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  42.86 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  40.68 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  34.91 
 
 
140 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  32.06 
 
 
164 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  39.09 
 
 
118 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  35.24 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  37.76 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  33.33 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  43.66 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  35.9 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  35.56 
 
 
141 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  33.63 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  33.01 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0720  hypothetical protein  32.93 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0185  hypothetical protein  31.71 
 
 
88 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112933  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  39.71 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  30.39 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  36.36 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0545  hypothetical protein  27.73 
 
 
155 aa  42.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  25.23 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  34.12 
 
 
148 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  44.9 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  32.22 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  32.56 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>