35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2365 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  100 
 
 
118 aa  231  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  53.15 
 
 
115 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  42.99 
 
 
108 aa  92  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  45.05 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  42.34 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  42.34 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  43.24 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  46.15 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  37.14 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  35.29 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  33.94 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  36.19 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  36.19 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  29.07 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  36.89 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  33.93 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  29.9 
 
 
156 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  29.46 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  29.91 
 
 
127 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  33.96 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  31.82 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  33.01 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  31.58 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  26.02 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  38.67 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  31.07 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  35.71 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  30.91 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  30.91 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  26.05 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  32.11 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  26.27 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  32.17 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  31.33 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>