29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1950 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  36.61 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  36.78 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  28.85 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  32.43 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  34.52 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  26.57 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  37.88 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  34.88 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  35.79 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0545  hypothetical protein  36.78 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  41.1 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  37.18 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  35.9 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  37.8 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  23.89 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  32.89 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  20.75 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  36.14 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  48.57 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  43.75 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  25.69 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  32.89 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  32.05 
 
 		 141 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  32.05 
 
 		 141 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  36.44 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  29.85 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  29.85 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  28.79 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>