33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07620 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  240  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  45.38 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  37.61 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  45.9 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  45.1 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  40.68 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  41.53 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  41.53 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  40 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  41.94 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  45.6 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  35.24 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  42.74 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  35.85 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  42.37 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6952  hypothetical protein  52.5 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  38.89 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  34.19 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  42.67 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  30.19 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  34.65 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  33.96 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  43.24 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  41.44 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  33.73 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  31.19 
 
 		 116 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  38.55 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  38.89 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>