48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2333 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  100 
 
 		 131 aa  259  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  61.16 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  59.5 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  57.38 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  60.33 
 
 		 168 aa  146  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  56.82 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  52.46 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  51.64 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  51.64 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  49.6 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  37.96 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  38.1 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  37.86 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  32.33 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  37.38 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  35.04 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  34.86 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  39.09 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  35.04 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  38.16 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  34.86 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  35.59 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  31.93 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  32.73 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  39.51 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  33.94 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  33.94 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  37.8 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  36.99 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  33.04 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  35.51 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  35.51 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  34.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  36.7 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  33.04 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  39.19 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  33.87 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  32.89 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  38.24 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  34.65 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  34.67 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  32.11 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>