32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2608 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  344  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  86.79 
 
 		 171 aa  251  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  66.18 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  58.04 
 
 		 174 aa  160  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  44.96 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  38.84 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  33.33 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  40.43 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  38.17 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  37.01 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  35.48 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0844  DoxX family protein  38.24 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450101  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  39.81 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  32.46 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  41.51 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  31.53 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  30.93 
 
 		 116 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  30.93 
 
 		 116 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  36.8 
 
 		 140 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  32.77 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  35.58 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  38.83 
 
 		 121 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  34.26 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  36.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  30.48 
 
 		 115 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  40.28 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  30.91 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  36.26 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  37.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  41.2  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>