34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4341 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  330  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  86.79 
 
 		 175 aa  250  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  61.39 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  59.57 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  44.53 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  39.81 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  32.17 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  37.25 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  37.8 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  28 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  38.24 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  38.3 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  31.96 
 
 		 115 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  39.62 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  29.9 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  29.9 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  34.62 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0844  DoxX family protein  36.99 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450101  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  31.78 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  33.98 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  38.83 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  38.36 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  33.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  36.26 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  34.41 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 140 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  33.65 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  33.98 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  33.65 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  32.04 
 
 		 138 aa  41.2  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  31.78 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>