30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4763 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  100 
 
 		 149 aa  286  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  68.33 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  54.78 
 
 		 152 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  46.9 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0844  DoxX family protein  53.39 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450101  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  39.69 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  38.52 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  38.94 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  40.74 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  40.51 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  37.7 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  36.46 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  40.91 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  38.68 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  42.7 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  35.8 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  32.8 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  36.79 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  33.6 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  33.62 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  41.25 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  32.2 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  31.58 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  36.59 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  38.1 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  35.38 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  34.18 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>