47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3912 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  100 
 
 		 140 aa  276  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  96.43 
 
 		 140 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  91.43 
 
 		 140 aa  256  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  62.5 
 
 		 168 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  59.5 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  50.74 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  52.34 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  54.05 
 
 		 158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  54.05 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  45.04 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  40.48 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  35.19 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  33.9 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  32.65 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  41.67 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  37.89 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  32.26 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  31.86 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  34.75 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  33.94 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  37.86 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  30.3 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  30.3 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  31.73 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  37.96 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  39.45 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  39.45 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  39.45 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  40.28 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  35.64 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  35.53 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  36.13 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  29.29 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  37.82 
 
 		 149 aa  43.5  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  26.61 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  32.56 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  34.75 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  35.71 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  32.56 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  33.33 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  33.64 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  34.48 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  38.89 
 
 		 171 aa  40  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>