29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5798 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  65.93 
 
 		 175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  61.69 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  61.39 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  42.18 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  36.67 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  28.77 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  38.36 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  51.79 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  51.79 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  37.7 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  37.23 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  32.58 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0844  DoxX family protein  37.96 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450101  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  39.08 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  33.87 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  33.9 
 
 		 121 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  31.96 
 
 		 115 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  34.38 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  35.92 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  36.79 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  27.59 
 
 		 116 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 116 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  26.98 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  47.37 
 
 		 129 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>