55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3783 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  100 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  56.35 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  56.35 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  56.35 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  55 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  49.6 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  46.72 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  43.24 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  48 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  43.36 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  45.37 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  38.13 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  41.74 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  46.15 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  35.71 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  42.5 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  39.32 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  43.66 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  41.67 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  39.66 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  36.84 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  38.32 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  35.06 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  34.88 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  37.27 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  33.02 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  34.23 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  31.17 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0185  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  34.18 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  39.24 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  40.86 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  36.84 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  58.33 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  35.53 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  29.46 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  37.78 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  31.36 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0560  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0572  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100695  hitchhiker  0.0053973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0550  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34704  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  32.38 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  32.38 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  31.08 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  39.71 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  35.53 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  34.67 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  34.72 
 
 		 118 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  36.59 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6952  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  33.66 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0720  hypothetical protein  32.35 
 
 		 88 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>