29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0585 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  277  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  68.38 
 
 
118 aa  167  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  57.81 
 
 
148 aa  151  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  57.26 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  53.54 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  55.04 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  55.04 
 
 
143 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  52.76 
 
 
127 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  56.9 
 
 
124 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  57.55 
 
 
129 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  50.76 
 
 
149 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  52.29 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  51.26 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  37.96 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  31.93 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  37.9 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  37.96 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  33.04 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  36.63 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  31.71 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  34.62 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  34 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  29.51 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  29.82 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  36.84 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  36.59 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  36.59 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  32.97 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.364562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>