32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5367 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  263  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  62.2 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  58.68 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  57.5 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  56.41 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  54.17 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  54.17 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  54.21 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  50.85 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  52 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  53.57 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  54.72 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  47.54 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  32.26 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  32.56 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  31.45 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  33.59 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  32.73 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  33.02 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  32.8 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  33.63 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  28.93 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  37.78 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  38.67 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  31.53 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  33.61 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  28.12 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  34.11 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  31.82 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>