36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2375 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  100 
 
 		 141 aa  283  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  62.02 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  61.67 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  53.54 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  58.68 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  55.8 
 
 		 162 aa  143  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  59.17 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  58.33 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  56.1 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  58.39 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  57.8 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  51.38 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  54.55 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  54.76 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  33.04 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  37.38 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  35.04 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  37.86 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  34.95 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  31.09 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  31.71 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  36.89 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  31.62 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  33.63 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  31.4 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  36.47 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  34.09 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  34.09 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  31.08 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  33.94 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  37.9 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  31.62 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  32.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>