31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1934 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  283  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  76.97 
 
 		 158 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  72.22 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  48.92 
 
 		 168 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  51.64 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  51.94 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  50.79 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  50.4 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  52.38 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  39.23 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  39.81 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  33.64 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  39.45 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  36.11 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  31.25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  35.29 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  32.23 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  31.82 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  32.53 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  41.03 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  27.12 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  33.96 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  31.91 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  31.33 
 
 		 131 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  29.67 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  27.82 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  30.23 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  30.23 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  34.58 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  34.31 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>