37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17130 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  100 
 
 		 129 aa  256  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  68.37 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  56.3 
 
 		 148 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  52.03 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  54.13 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  51.22 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  51.22 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  57.55 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  61.32 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  68.18 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  57.8 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  56.9 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  54.72 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  55.56 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  40.48 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  42.06 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  39.68 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  32.99 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  35.19 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  37.38 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  34.91 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  36.11 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  31.96 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  36.63 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  39.6 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  39.82 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  36.54 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  31.48 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  42.86 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  39.71 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  26.8 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  33.66 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  39.44 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  39.44 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  34.04 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  40.79 
 
 		 167 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>