32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1282 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  295  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  62.5 
 
 
148 aa  167  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  65.29 
 
 
127 aa  159  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  58.39 
 
 
141 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  59.38 
 
 
143 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  59.38 
 
 
162 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  59.38 
 
 
143 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  68.18 
 
 
129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  52 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  57.6 
 
 
124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  50.76 
 
 
138 aa  133  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  61.11 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  51.75 
 
 
118 aa  123  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  62.2 
 
 
145 aa  106  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  38.52 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  36.61 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  34.92 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  36.21 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  37.7 
 
 
140 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  29.13 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  37.82 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  37.1 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  36.89 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  33.64 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  35.43 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  30.34 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  32.5 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  35.78 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  28.33 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  31.62 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  26.67 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  29.69 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.592546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>