13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0434 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  35.04 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  33.86 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  33.02 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  34.86 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  33.02 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  29.63 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  33.96 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  25.23 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  35.42 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  28.87 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>