29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2364 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  62.2 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  62.81 
 
 		 148 aa  150  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  61.67 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  65.29 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  54.1 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  52.76 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  53.28 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  53.28 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  59.09 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  61.32 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  53.39 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  53.21 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  33.94 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  32.41 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  33.94 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  32.52 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  33.03 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  29.66 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  29.92 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  30.71 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  27.35 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>