51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0849 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  241  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  65.66 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  49.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  49.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  47.54 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  48.39 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  48.65 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  42.28 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  43.36 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  49.57 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  60.91 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  46.46 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  49.02 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  43.88 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  39.09 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  46.09 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  40.74 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  33.91 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1591  membrane protein-like  62.5 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  29.91 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  38.05 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  37.9 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  38.53 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  29.52 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  26.36 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  32.71 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  33.09 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  34.55 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  38.89 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  37.93 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  32.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  35.65 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  34.71 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  33.02 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  38.94 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  33.8 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  38.94 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  33.8 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  23.73 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  35.53 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  40.38 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  38.94 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  35.05 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  34.57 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0185  hypothetical protein  27.71 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  29.84 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0550  hypothetical protein  39.34 
 
 		 88 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34704  normal  0.692759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>