49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06260 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  100 
 
 		 129 aa  247  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  52.99 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  52.99 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  53.6 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  57.01 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  60.91 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  53.66 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  52.99 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  59.18 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  46.15 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  53.85 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  39.67 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  45.22 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  50.43 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  43.88 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  48.61 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  36.73 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  31.01 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  37.19 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  33.88 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  37.74 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  34.62 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  40 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  30.84 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  35.83 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  43.42 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  43.42 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  32.61 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0550  hypothetical protein  35.44 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34704  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  34.82 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0572  hypothetical protein  34.18 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100695  hitchhiker  0.0053973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0560  hypothetical protein  34.18 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  41.56 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  33.33 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  29.81 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  29.81 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0720  hypothetical protein  35.44 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  43.84 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  33.88 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  36.36 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  36.29 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1591  membrane protein-like  63.08 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>