47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6239 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  254  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  53.7 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  53.7 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  65.14 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  54.21 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  45.45 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  53.7 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  54.08 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  48.6 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  46.73 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  43.97 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  45.38 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  54.62 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  42.27 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  40.19 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  46.55 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  34.31 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  35.34 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  35.34 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  35.48 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  31.97 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  33.87 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  26.55 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  34.68 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  34.68 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  33.94 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  26.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0720  hypothetical protein  37.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0185  hypothetical protein  38.81 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1591  membrane protein-like  59.77 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  28.04 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  35.19 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  36.28 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  33.87 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  25.42 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  31.53 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  35.35 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  34.18 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  33.87 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  32.91 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  31.58 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  33.33 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>