22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3281 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  100 
 
 		 167 aa  334  3.9999999999999995e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  47.44 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  36.52 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  44.87 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  46.15 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  47.95 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  37.97 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  39.24 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  47.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  58.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  39.19 
 
 		 131 aa  44.7  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  43.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  43.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  37.18 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  37.18 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  37.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  35.53 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  34.34 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  44.9 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  38.16 
 
 		 116 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>