47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1591 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1591  membrane protein-like  100 
 
 		 145 aa  262  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  64.22 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  41.09 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  51.75 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  46.85 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  46.85 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  57.14 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  43.24 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  58.06 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  46.85 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  38.46 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  50 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  54.29 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  47.27 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  54.21 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  47.79 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  41.82 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  34.17 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  32.67 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  32.67 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  36.36 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  45.12 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  45.45 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  31.48 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  38.52 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  37.86 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  42.65 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  39.47 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  25.96 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6952  hypothetical protein  48.81 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  40.79 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  30.19 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  27.93 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  38.36 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  37.97 
 
 		 168 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  29.25 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  36.11 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  37.65 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  31.71 
 
 		 148 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  41.18 
 
 		 144 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  41.1 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0545  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  36.25 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  38.46 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>