More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2715 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 529 aa  1095    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.39 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.93 
 
 		 552 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  48.28 
 
 		 542 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.5 
 
 		 528 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.28 
 
 		 544 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.73 
 
 		 543 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46 
 
 		 547 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.88 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.09 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.95 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.08 
 
 		 523 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.65 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  43.48 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.33 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.46 
 
 		 503 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.61 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.55 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.41 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  41.94 
 
 		 513 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.03 
 
 		 505 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.03 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  41.59 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.03 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.28 
 
 		 504 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.13 
 
 		 504 aa  350  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.92 
 
 		 477 aa  316  8e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.29 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.13 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.41 
 
 		 478 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.84 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.13 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  30.95 
 
 		 489 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.4 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.15 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  33.33 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  33.33 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  33.33 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  33.33 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  33.33 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  33.33 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  33.33 
 
 		 477 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.22 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  29.62 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.13 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.12 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.22 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 		 480 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.78 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.87 
 
 		 483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  32.83 
 
 		 480 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.86 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.3 
 
 		 454 aa  171  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  34.25 
 
 		 481 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.66 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  32.54 
 
 		 478 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  29.52 
 
 		 488 aa  169  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.6 
 
 		 478 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.24 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  29.82 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  32.63 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  31.22 
 
 		 430 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.07 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.88 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.14 
 
 		 458 aa  143  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.14 
 
 		 458 aa  143  9e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.14 
 
 		 458 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.1 
 
 		 474 aa  133  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.38 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.55 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.88 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.55 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  24.2 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 454 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  25.82 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.92 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.63 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  24.71 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.93 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.11 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.57 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.78 
 
 		 461 aa  93.6  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.56 
 
 		 458 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.8 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.54 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.84 
 
 		 470 aa  90.1  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  23.56 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  22.17 
 
 		 458 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.77 
 
 		 450 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.38 
 
 		 485 aa  87.8  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.28 
 
 		 460 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.35 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>