88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2482 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1134    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  22.46 
 
 
590 aa  80.5  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  31.45 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  30.83 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  31.45 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 
974 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1792  5'-Nucleotidase domain protein  24.18 
 
 
549 aa  68.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.96208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  30.53 
 
 
156 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  31.71 
 
 
155 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  26.71 
 
 
590 aa  65.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4699  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.16 
 
 
616 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  22.68 
 
 
633 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0350  5'-Nucleotidase domain protein  23.69 
 
 
547 aa  63.9  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.927077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  36.46 
 
 
236 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  30.65 
 
 
153 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4198  5'-Nucleotidase domain protein  25.09 
 
 
631 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4481  5'-Nucleotidase domain protein  26.02 
 
 
631 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.46 
 
 
587 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  24.67 
 
 
558 aa  57  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.49 
 
 
555 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2550  hypothetical protein  21.75 
 
 
697 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017247  hitchhiker  0.000000000139716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  32.98 
 
 
235 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  32.98 
 
 
235 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  32.98 
 
 
235 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  23.41 
 
 
523 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2414  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.19 
 
 
648 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2743  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  22.81 
 
 
652 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0931599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2536  hypothetical protein  22.18 
 
 
650 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.19344e-31 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.66 
 
 
607 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2418  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.45 
 
 
724 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  29.66 
 
 
240 aa  53.9  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  24.38 
 
 
505 aa  53.9  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  25.58 
 
 
638 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  25.68 
 
 
508 aa  53.5  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.23 
 
 
821 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2189  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  25 
 
 
653 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  35.64 
 
 
171 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2304  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  21.54 
 
 
650 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.199314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2261  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  21.54 
 
 
671 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0897144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.76 
 
 
535 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.29 
 
 
601 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3401  hypothetical protein  30.45 
 
 
330 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106524  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
315 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.03 
 
 
553 aa  50.4  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  24.81 
 
 
489 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  23.96 
 
 
520 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  29.91 
 
 
394 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  23.46 
 
 
581 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0392  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  24.16 
 
 
648 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0453  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  23.48 
 
 
650 aa  47.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309486  normal  0.0372804 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  27.54 
 
 
563 aa  47.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  31.82 
 
 
697 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4467  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  23.79 
 
 
647 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4783  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  23.79 
 
 
647 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.47 
 
 
530 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0600  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.81 
 
 
630 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0113875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.31 
 
 
722 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.83 
 
 
517 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  24.66 
 
 
572 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3867  5'-nucleotidase-like  26.47 
 
 
655 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.215623  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 
523 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
520 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.69 
 
 
1181 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
523 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.69 
 
 
1175 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  19.87 
 
 
1202 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
520 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4692  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  23.42 
 
 
647 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0783  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  22.15 
 
 
648 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.156862  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1811  5'-nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 
632 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0652908  normal  0.0688595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04085  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  23.42 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75868  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  36.62 
 
 
556 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.28 
 
 
1284 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3793  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  23.42 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  23.85 
 
 
313 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04048  hypothetical protein  23.42 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.897161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  28.28 
 
 
390 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4821  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  24.07 
 
 
647 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.458027  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4801  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  24.07 
 
 
647 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5730  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  23.42 
 
 
647 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.122281  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4766  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  24.07 
 
 
647 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.675138  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  27.1 
 
 
391 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4671  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  24.07 
 
 
647 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2162  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  22.59 
 
 
694 aa  43.9  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00580224  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  30.56 
 
 
156 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0376163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>