18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2711 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  100 
 
 		 156 aa  321  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  71.43 
 
 		 148 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  60.27 
 
 		 153 aa  178  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  61.27 
 
 		 192 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  49.68 
 
 		 179 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  59.85 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  31.45 
 
 		 561 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  32.14 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  32.87 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  25.45 
 
 		 590 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  39.53 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  29.51 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  30.08 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  46.3 
 
 		 649 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  30.08 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  30 
 
 		 235 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  30 
 
 		 235 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  30 
 
 		 235 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>