22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5591 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  334  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  44.52 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  46.09 
 
 
181 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  46.09 
 
 
178 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  45.31 
 
 
156 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.12 
 
 
974 aa  74.7  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.94 
 
 
821 aa  60.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  32.31 
 
 
561 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  24.07 
 
 
590 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  34.19 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  32 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  27.61 
 
 
236 aa  54.3  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  33.12 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  30.3 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2770  hypothetical protein  29.44 
 
 
477 aa  51.2  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  26.43 
 
 
240 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  28.47 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  29.79 
 
 
235 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  29.79 
 
 
235 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  29.79 
 
 
235 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  27.96 
 
 
490 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>