25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2868 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  342  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  98.62 
 
 
174 aa  281  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  94.81 
 
 
181 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  71.67 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  53.19 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.9 
 
 
821 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.76 
 
 
974 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0765  hypothetical protein  33.96 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0765  hypothetical protein  33.96 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00448786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0728  hypothetical protein  33.96 
 
 
213 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0433074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  28.16 
 
 
240 aa  57.8  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  33.33 
 
 
561 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  25.6 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  27.59 
 
 
590 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0771  hypothetical protein  34.62 
 
 
234 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  28 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  28.78 
 
 
235 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  28.78 
 
 
235 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  28.78 
 
 
235 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  32.39 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  31.43 
 
 
651 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  24.39 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  26.43 
 
 
192 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>