23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2582 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  49.53 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  49.53 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  49.53 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  41.25 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.67 
 
 		 974 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  36.46 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  35.45 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  37.62 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.38 
 
 		 821 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  32.14 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  35.09 
 
 		 155 aa  52.4  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  31.85 
 
 		 153 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  31.37 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  27.54 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  26.22 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  32.23 
 
 		 148 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  26.81 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  25.17 
 
 		 590 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  22.67 
 
 		 391 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  26.71 
 
 		 394 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  30.25 
 
 		 697 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>