17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2062 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  100 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  65.87 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  60.47 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  49.68 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  55.64 
 
 		 148 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  51.91 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  30.47 
 
 		 561 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  37.62 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  28.67 
 
 		 590 aa  58.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.12 
 
 		 974 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  33.33 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  30.39 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  30.39 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  30.39 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  36.26 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0030  hypothetical protein  23.25 
 
 		 405 aa  44.7  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  33.33 
 
 		 789 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>