26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2858 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  60.27 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  65.89 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  51.61 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  51.91 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  52.31 
 
 		 192 aa  147  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  30.65 
 
 		 561 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.4 
 
 		 974 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  31.85 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  29.31 
 
 		 590 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  29.61 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  29.91 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  25 
 
 		 299 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  28.97 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  32.94 
 
 		 758 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  29.77 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  27.34 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  29.52 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  29.52 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  29.52 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0862  hypothetical protein  23.88 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 802 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  30 
 
 		 312 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  25.43 
 
 		 299 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 764 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>