25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0249 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  100 
 
 
155 aa  324  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  65.91 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  60.47 
 
 
179 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  55.63 
 
 
148 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  51.61 
 
 
153 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  59.85 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  31.71 
 
 
561 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  29.86 
 
 
590 aa  60.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  28.36 
 
 
240 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  35.09 
 
 
236 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.15 
 
 
821 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.85 
 
 
974 aa  51.2  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  26.57 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  36 
 
 
235 aa  48.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  36 
 
 
235 aa  48.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  36 
 
 
235 aa  48.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  33.68 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  26.61 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  26.61 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  35.9 
 
 
307 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  29.52 
 
 
650 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  29.52 
 
 
650 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  29.52 
 
 
650 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  29.52 
 
 
650 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  34.78 
 
 
555 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>