233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2064 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
361 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  59.3 
 
 
348 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  55.74 
 
 
348 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  48.88 
 
 
355 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 
355 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  48.6 
 
 
355 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  47.77 
 
 
355 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  50.88 
 
 
356 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  50.59 
 
 
356 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 
355 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  47.21 
 
 
355 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  49.45 
 
 
363 aa  355  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  46.65 
 
 
355 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  45.81 
 
 
355 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  48 
 
 
354 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  45.87 
 
 
354 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  49.02 
 
 
353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  43.91 
 
 
355 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  49.86 
 
 
362 aa  317  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  46.63 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  44 
 
 
357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  42.02 
 
 
370 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  47.41 
 
 
357 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  43.7 
 
 
429 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
354 aa  298  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.89 
 
 
380 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  47.62 
 
 
358 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  47.62 
 
 
358 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  47.9 
 
 
358 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  47.34 
 
 
358 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  47.62 
 
 
876 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  47.34 
 
 
358 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  47.34 
 
 
358 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  47.34 
 
 
358 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  47.35 
 
 
379 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  44.93 
 
 
352 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  42.65 
 
 
351 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  43.07 
 
 
350 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  42.69 
 
 
403 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  43.14 
 
 
358 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  42.9 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  41.98 
 
 
356 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
344 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  39.65 
 
 
341 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.88 
 
 
815 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  39.34 
 
 
359 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.85 
 
 
339 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 
315 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  41.8 
 
 
349 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  37.28 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  37.32 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.19 
 
 
338 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 
344 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  39.87 
 
 
353 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 
347 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
349 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.23 
 
 
338 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  39.41 
 
 
362 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  35.34 
 
 
364 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
377 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  37.32 
 
 
353 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  37.97 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  35.04 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  37.53 
 
 
357 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  37.03 
 
 
343 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  34.46 
 
 
352 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 
353 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 
338 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 
343 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  36.18 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
343 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
343 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
343 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
356 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 
352 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  37.32 
 
 
342 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  36.7 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  36.7 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  36.7 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  34.47 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  34.84 
 
 
343 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 
347 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  37.06 
 
 
358 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  35.64 
 
 
451 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  34.57 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  39.34 
 
 
360 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 
339 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 
352 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  37.37 
 
 
340 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  34.83 
 
 
343 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  36.49 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>