67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2059 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  100 
 
 		 104 aa  213  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  64.52 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  61.86 
 
 		 232 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  56.99 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  52.22 
 
 		 475 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  51.02 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  41.67 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  44 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  42.05 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  42.05 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  39.18 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  39.18 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  34.62 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  40.7 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  34.41 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  44.05 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  35.71 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  30.77 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  38.37 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  32.18 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  32.18 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  32.98 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  38.1 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  34.69 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  36.47 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  31.91 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  31.91 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  31.91 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  36.47 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  34.09 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  28.72 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  31.03 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  32.93 
 
 		 386 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  31.03 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  30.85 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  27.66 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  27.66 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  27.66 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  31.94 
 
 		 367 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  29.79 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  31.73 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  29.79 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  31.33 
 
 		 372 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  28.72 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  36.78 
 
 		 359 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  29.67 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  33.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3678  Chorismate mutase  38.37 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  32 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  30.59 
 
 		 359 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  32 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 384 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  31.46 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  33.68 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  29.17 
 
 		 357 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.56 
 
 		 375 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.03 
 
 		 383 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  26.32 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 		 379 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  34.94 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2513  Chorismate mutase  29.76 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.514651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.81 
 
 		 384 aa  40  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>