More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1467 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 
890 aa  861    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 
890 aa  861    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  61.31 
 
 
992 aa  801    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 
883 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  64.98 
 
 
846 aa  815    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  63.95 
 
 
828 aa  803    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  62.19 
 
 
892 aa  809    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 
887 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  64.17 
 
 
868 aa  797    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  63.12 
 
 
964 aa  801    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  64.14 
 
 
880 aa  826    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  61.75 
 
 
889 aa  821    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 
975 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  60.78 
 
 
975 aa  814    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 
959 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  62.23 
 
 
885 aa  829    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  65.31 
 
 
841 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  64.11 
 
 
854 aa  803    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 
692 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 
890 aa  861    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 
975 aa  816    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  53 
 
 
868 aa  876    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  53 
 
 
868 aa  881    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  65.48 
 
 
841 aa  800    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 
908 aa  751    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  57.29 
 
 
904 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 
836 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  64.38 
 
 
966 aa  789    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
922 aa  810    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  61.24 
 
 
898 aa  815    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  60.78 
 
 
975 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 
845 aa  878    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  64.6 
 
 
837 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 
836 aa  651    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 
947 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  59.88 
 
 
972 aa  817    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  63.13 
 
 
948 aa  774    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  62.01 
 
 
943 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  66.24 
 
 
896 aa  839    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  55.19 
 
 
884 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  64.14 
 
 
880 aa  826    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  61.6 
 
 
818 aa  763    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  56.1 
 
 
832 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  62.88 
 
 
885 aa  839    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  60.1 
 
 
990 aa  734    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  59.81 
 
 
876 aa  762    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 
873 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  62.19 
 
 
892 aa  809    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  60.9 
 
 
976 aa  821    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  63.87 
 
 
895 aa  834    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  62.2 
 
 
953 aa  753    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  63.28 
 
 
816 aa  821    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 
890 aa  861    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  64.13 
 
 
978 aa  757    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
908 aa  779    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  61.95 
 
 
920 aa  763    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.37 
 
 
907 aa  853    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  59.94 
 
 
968 aa  777    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  64.5 
 
 
989 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  62.18 
 
 
884 aa  828    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  64.98 
 
 
846 aa  816    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  66.5 
 
 
843 aa  805    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  57.75 
 
 
908 aa  754    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  64.71 
 
 
979 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  47.73 
 
 
880 aa  759    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 
898 aa  863    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 
835 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  65.12 
 
 
837 aa  806    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  60.33 
 
 
971 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  64.83 
 
 
890 aa  789    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  65.25 
 
 
869 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  66.95 
 
 
896 aa  827    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  58.6 
 
 
905 aa  743    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  57.29 
 
 
882 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  60.89 
 
 
969 aa  806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 
831 aa  786    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  62.85 
 
 
885 aa  830    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  62.85 
 
 
885 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  65.66 
 
 
883 aa  841    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.15 
 
 
881 aa  864    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 
890 aa  861    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  65.48 
 
 
894 aa  828    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  60.98 
 
 
971 aa  810    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  65.12 
 
 
840 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  64.14 
 
 
880 aa  826    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 
975 aa  816    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 
884 aa  848    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  59.91 
 
 
943 aa  771    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  60.33 
 
 
971 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  63.28 
 
 
803 aa  820    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  55.18 
 
 
949 aa  675    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  62.08 
 
 
889 aa  829    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  60.78 
 
 
975 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  63.97 
 
 
880 aa  827    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 
921 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 
975 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  52.16 
 
 
848 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  62.69 
 
 
882 aa  836    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 
880 aa  874    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  63.64 
 
 
848 aa  787    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>