More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3165 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 367 aa  725    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.64 
 
 		 378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  62.39 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0789  peptidase M20  52.28 
 
 		 381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0672  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.75 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.573003  normal  0.0211089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  31.78 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.78 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  35.05 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  30.73 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  30.73 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  30.73 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  30.73 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  30.73 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  35.06 
 
 		 335 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  31.34 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.68 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  37.38 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  28.85 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.84 
 
 		 412 aa  105  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.81 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  33.13 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.73 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  31.16 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  33.91 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  33.01 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  31.99 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  32.18 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  28.42 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 		 383 aa  99.8  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  28.17 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  32.55 
 
 		 422 aa  99.4  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 		 384 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  31.75 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  31.56 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  31.43 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  27.92 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  35.29 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  30.79 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  30.54 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  29.85 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  30.46 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  27.25 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  28.92 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  25.69 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  27.27 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.27 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.27 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.27 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.27 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.27 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.05 
 
 		 400 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.27 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  28.94 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  30.95 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.05 
 
 		 400 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  26.4 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.52 
 
 		 586 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  27.7 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  30.67 
 
 		 389 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.05 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 		 383 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  29.49 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  31.53 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  28.45 
 
 		 382 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.83 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  30.67 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  29.18 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.36 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  31.49 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  29.35 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  29.61 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  26.77 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  32.23 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  27.22 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>