More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0684 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
264 aa  530  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112246  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  31 
 
 
324 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  28.31 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  29.71 
 
 
349 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  31.08 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  26.32 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  26.76 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  31.74 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  25.81 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  28.75 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  31.74 
 
 
329 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  29.15 
 
 
320 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  28.63 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
311 aa  65.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2563  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  30.2 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  29.14 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
311 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  28.95 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  27.75 
 
 
329 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  25.66 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.63 
 
 
310 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  27.8 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
336 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 
313 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185672  normal  0.626445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  30.03 
 
 
330 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.3 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
317 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
318 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.67 
 
 
334 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  27.82 
 
 
308 aa  62.4  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  24.92 
 
 
329 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
309 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.46 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.32 
 
 
641 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
336 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  30.03 
 
 
330 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1520  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  28.24 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00376715  hitchhiker  3.69674e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  28.89 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  28.75 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  27.42 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  26.67 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.61 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  27.7 
 
 
335 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 
334 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  29.43 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  31.14 
 
 
328 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  27.7 
 
 
335 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
308 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
309 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1553  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  30.3 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.687648  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  28.52 
 
 
340 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  27.31 
 
 
302 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  30.26 
 
 
332 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  25.57 
 
 
326 aa  58.9  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.84 
 
 
376 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  29.14 
 
 
330 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  27.89 
 
 
328 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
335 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
335 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1680  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  22.18 
 
 
318 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.178648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 
351 aa  58.5  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  28.9 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
334 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  29.47 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  38.02 
 
 
366 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  22.18 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.873071  normal  0.0436557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  31.01 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>