50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3544 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 406 aa  796    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  28.67 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  24.65 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  26.42 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  22.62 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  26.92 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  26.19 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 445 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  19.88 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  23.13 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  21.15 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 448 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  21.68 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 386 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  27.05 
 
 		 685 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  35.77 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  25.88 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>