105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2683 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  43.61 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  44.11 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  46.39 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  43.51 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36.82 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  30.57 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  27.24 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  33.77 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  24.34 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  32.76 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  26.27 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  32.89 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  42.31 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  45.74 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  30.37 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  40.91 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  25.98 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  31.86 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  42.31 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  38.75 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  24.63 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  22.43 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  26.55 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  26.35 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  30.73 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  30.97 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  30.97 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  30.97 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  30.97 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  30.97 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  27.36 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  26.18 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  30.99 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  46.03 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  30.41 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  27.92 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  34.12 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  28.24 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  26.43 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.9 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  39.51 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  26.86 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  37.65 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 357 aa  52.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  27.63 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  23.56 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  42.03 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  42.03 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  31.14 
 
 		 355 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  47.27 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  39.13 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  32.05 
 
 		 119 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  24.82 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  24.82 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  24.82 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  24.82 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  29.55 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  29.05 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  24.49 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.48 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  30.77 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 373 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  35.21 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4640  transcriptional regulator, TrmB  29.81 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  26.82 
 
 		 350 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>