289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0439 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 351 aa  701    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  72.22 
 
 		 359 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  72.16 
 
 		 331 aa  493  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  66.67 
 
 		 329 aa  458  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  64.66 
 
 		 330 aa  432  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  59.65 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  53.82 
 
 		 329 aa  325  9e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  45.53 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  41.55 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 326 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  41.25 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  40.47 
 
 		 326 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  40.88 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  42.2 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  40.68 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  38.84 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  34.56 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.46 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30.37 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  30.09 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.71 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.56 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.18 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.44 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.65 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  33.99 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  35.66 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.88 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.07 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.25 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.49 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.25 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.32 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  38.27 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  35.14 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  30.9 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  30.75 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  27.25 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  27.25 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  31.64 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  31.5 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  31.16 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.35 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  28.83 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  28.83 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  24.79 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  34.34 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  24.79 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.12 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  30.46 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  31.79 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  30.75 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  28.82 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  30.88 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  26.48 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  32.21 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.21 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  31.52 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  30.17 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.24 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  31.34 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  29.89 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  29.91 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  31.16 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  32.83 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  29.8 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  32.24 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  30.9 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>