284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1820 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
530 aa  1064    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  44.8 
 
 
523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  43.55 
 
 
523 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  39.48 
 
 
533 aa  321  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  39.47 
 
 
514 aa  320  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  38.62 
 
 
509 aa  309  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  38.46 
 
 
517 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  40.95 
 
 
508 aa  297  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 
511 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 
535 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  37.9 
 
 
523 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  32.49 
 
 
509 aa  290  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  38.22 
 
 
515 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 
518 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  37.32 
 
 
511 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  38.81 
 
 
520 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  33.47 
 
 
508 aa  286  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  37.08 
 
 
507 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  37.23 
 
 
511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  39.29 
 
 
515 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 
504 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  31.54 
 
 
516 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 
504 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  37.3 
 
 
511 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  36.56 
 
 
511 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  39.12 
 
 
511 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  38.1 
 
 
518 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  33.87 
 
 
507 aa  279  9e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  36.71 
 
 
511 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  38.26 
 
 
515 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  34.62 
 
 
513 aa  277  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  37.17 
 
 
514 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  34.05 
 
 
509 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  39.39 
 
 
518 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
507 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 
489 aa  276  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  34.41 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  34.41 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  36.73 
 
 
511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  35.15 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  34.41 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  39 
 
 
512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  37.43 
 
 
506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  34.41 
 
 
513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  37.7 
 
 
522 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  35.15 
 
 
513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  35.15 
 
 
513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  35.15 
 
 
513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  33.53 
 
 
506 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  38.14 
 
 
511 aa  273  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3645  histidine ammonia-lyase  38.71 
 
 
520 aa  273  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  37.7 
 
 
506 aa  272  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  40.25 
 
 
508 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  36.82 
 
 
507 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.8 
 
 
507 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 
510 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2965  histidine ammonia-lyase  38.46 
 
 
512 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.048059  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  37.79 
 
 
511 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  34.85 
 
 
510 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  37.08 
 
 
506 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  37.82 
 
 
506 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  33.66 
 
 
510 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  36.89 
 
 
513 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  36.62 
 
 
507 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 
507 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  39.29 
 
 
514 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 
511 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  36.88 
 
 
507 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  37.23 
 
 
507 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 
510 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  38.13 
 
 
511 aa  270  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
508 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 
508 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  36.95 
 
 
507 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  36.97 
 
 
518 aa  269  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  39.12 
 
 
507 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 
506 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  39.12 
 
 
529 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 
512 aa  269  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  34.21 
 
 
508 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  36.14 
 
 
507 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26290  histidine ammonia-lyase  37.78 
 
 
509 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  36.63 
 
 
506 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 
529 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 
507 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 
507 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 
533 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 
510 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  34.62 
 
 
515 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  36.44 
 
 
526 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  34.05 
 
 
510 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 
505 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  34.45 
 
 
519 aa  265  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 
506 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 
511 aa  264  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 
505 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 
512 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  32.36 
 
 
505 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  34.27 
 
 
511 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  36.19 
 
 
506 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>