50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1558 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  100 
 
 		 472 aa  939    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  45.47 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  42.06 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  39.87 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  33.41 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  33.54 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  32.56 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  37.29 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  31.24 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  31.66 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  30.97 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  29.34 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  31.34 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  28.79 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  21.95 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  24.95 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.94 
 
 		 437 aa  67  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  29.48 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  23.28 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  23.78 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  23.5 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  29.3 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  23.56 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 501 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 717 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  30.29 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  23.36 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  30.92 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  27.17 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  27.17 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.94 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  29.33 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  30.94 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.52 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  29.14 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  27.41 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  29.33 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  23.38 
 
 		 385 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  30.98 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  30.72 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  24.57 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  33.04 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  31.85 
 
 		 580 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  21.98 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  52.63 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  28.93 
 
 		 432 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>